Å komme seg til Flatflesa Fyr er en del av opplevelsen i seg selv. Omgitt av åpent hav mellom Ålesund og Molde er øya kun tilgjengelig med båt eller helikopter, noe som skaper en sjelden følelse av privatliv og avstand til fastlandet.

Transport til Flatflesa Fyr kan organiseres med helikopter, charterbåt eller RIB. Helikopter er det raskeste alternativet, mens båtoverfarter gir en roligere ankomst gjennom det vakre kystlandskapet på Vestlandet.

Overfarten tar omtrent 15 minutter fra Aukra eller Finnøy, og rundt 30 minutter fra Brattvåg. Gjester som reiser fra andre steder kan også få organisert transport fra Ålesund og Molde som en del av oppholdet.

Vær- og sjøforhold vurderes alltid før avreise for å sikre en trygg og komfortabel reise til øya.